Die Klinik wurde von Dr. August von Hauner gegründet. Als Armenarzt hat er im Jahre 1846 eines der ersten Kinderkrankenhäuser in Deutschland etabliert.

Das Dr. von Haunersche Kinderspital ist Teil des Klinikums der Universität München, einer der größten Universitätskliniken in Deutschland und Europa.

Das Kinderspital existiert seit 1998 in seiner jetzigen Form. Mit ca. 200 Betten, sowie drei Intensivstationen ist es  ein Krankenhaus der Maximalversorgung.

Jährlich werden mehr als 6500 Fälle in der Klinik stationär behandelt.